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上海玉研科學(xué)儀器有限公司
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斑馬魚行為學(xué)視頻分析軟件

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行為學(xué)視頻分析軟件,用于大小鼠行為學(xué)研究.
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產(chǎn)品詳情

LoliTrack5是一款超級快速直觀的Windows軟件,用于2D和3D視頻跟蹤和動物行為分析。簡單地,從你的相機加載一個視頻文件到軟件,并開始跟蹤。跟蹤是基于對比或背景減法(不需要標(biāo)記),并且具有豐富的工具模塊可用于深入分析動物行為。



獨特的是,LoliTrack5可以在處理遮擋(即交叉軌跡)時識別和跟蹤自由放散的群體,如魚群、蟲群或群體中未標(biāo)記動物等。




LoliTrack5 的應(yīng)用:

·微孔板分析(如對斑馬魚分析)

·行為表型(病灶動物)

·嚙齒動物試驗(例如在迷宮或露天野外試驗)

·群體行為(如昆蟲、浮魚和微生物)

·移動行為(例如在籠子,水族館和野外)

·社會和性行為(如IID和動物取向)


使用方式:


LoliTrack5適用于大多數(shù)相機和視頻文件格式。只需用相機錄制一個視頻文件,并將視頻加載到軟件中開始跟蹤。該軟件也具有視頻錄制和編輯工具,使用方便,一站式解決。


使用標(biāo)配或自備的視頻采集設(shè)備采集到動物的運動圖像,導(dǎo)入到LoliTrack5中進(jìn)行識別和分析,即可輸出分析數(shù)據(jù),可分析參數(shù)包括如:位置、速度、加速度、方向、旋轉(zhuǎn)等。


產(chǎn)品特點:

1.同時追蹤1-24只動物(一個單位容器)

2.支持多個單位容器同時追蹤,如24、48、96孔板等

3.兼容大多是相機和視頻格式

4.具有豐富的分析工具集,可分析20+個數(shù)據(jù)參數(shù)

5.確定具體的身體點進(jìn)行運動和運動學(xué)研究

6.生成并導(dǎo)出數(shù)據(jù)參數(shù)和分布熱圖

7.具有可定制圖形的深度分析工具

8.可用頻率分析估計心率和鰓頻率

9.真正的三維跟蹤導(dǎo)出坐標(biāo)和三維路徑

10.批量分析多個視頻,節(jié)省時間



分析參數(shù):

1.加速度

2.移動距離

3.速度和速度

4.激*/非激*時間和%

5.到區(qū)域中心的距離

6.在區(qū)域中花費的時間和百分比

7.運動方向和方向

8.轉(zhuǎn)動速度:移動或方向的轉(zhuǎn)動速度

9.動物到區(qū)域中心的距離

10.個體間距離(IID)

11.平均個體間距離(AIID)

12.個體間距離中位數(shù)(MIID)

13.*近鄰距離(NND)

14.彎曲(即身體擺動的角度,如尾拍頻率等)

15.前、后、中線中心和重心的原始和校準(zhǔn)的X/Y位置



軟件功能示例:

可以選擇單個的動物進(jìn)行跟蹤和分析,而不是必須跟蹤所有的動物。自定義名稱和標(biāo)簽顏色,便于識別。還可以在視頻時間軸上選擇用戶自定義的時間間隔,以排除特定的視頻片段進(jìn)行跟蹤。





如果您想要分析特定感興趣區(qū)域內(nèi)的動物行為,可以直接在視頻預(yù)覽中繪制任意數(shù)量的區(qū)域。對每個區(qū)域的行為進(jìn)行評分,并自動導(dǎo)出每個區(qū)域的統(tǒng)計數(shù)據(jù)。


識別特定的身體點(尾巴、頭部、中線中心、重心),并可以單獨跟蹤每個點,用于研究運動學(xué)(尾部拍頻、身體振蕩等)或特定行為(方向或運動方向、轉(zhuǎn)彎速率等)。其他有用的工具包括根據(jù)位置、速度、加速度、活動和轉(zhuǎn)彎速率生成動物的中線和熱圖。

您可以將所有數(shù)據(jù)參數(shù)導(dǎo)出為.xlsx文件到Excel,只需單擊一次。導(dǎo)出每個參數(shù)或選擇你需要的參數(shù)。在導(dǎo)出的文件中,您

可以獲得單個動物、動物組以及每個用戶定義的測試單元和區(qū)域的分析數(shù)據(jù)和原始數(shù)據(jù)。在LoliTrack5中,一些參數(shù)也可以作為可定制或作為圖形導(dǎo)出。



通過兩個攝像頭或文件(立體技術(shù)),LoliTrack5提供了在空氣或水中的焦點動物的真實3D視頻跟蹤,考慮到空氣到水的光傳輸因素。坐標(biāo)以及軌跡的數(shù)字3D模型可以以不同的格式導(dǎo)出,以便在其他軟件包中進(jìn)一步可視化或分析。






相關(guān)文獻(xiàn):

1) Alcaraz A J G, Baraniuk S, Mikulá?ek K, et al. Comparative analysis of transcriptomic points-of-departure (tPODs) and apical responses in embryo-larval fathead minnows exposed to fluoxetine[J]. Environmental Pollution, 2022, 295: 118667.
2) Di Cicco M, Di Lorenzo T, Fiasca B, et al. Effects of diclofenac on the swimming behavior and antioxidant enzyme activities of the freshwater interstitial crustacean Bryocamptus pygmaeus (Crustacea, Harpacticoida)[J]. Science of the Total Environment, 2021, 799:149461.
3) Wang X, Cheng E, Burnett I S, et al. Automatic multiple zebrafish larvae tracking in unconstrained microscopic video conditions[J]. Scientific reports, 2017, 7(1): 17596.
4) Henry J, Rodriguez A, Wlodkowic D. Impact of digital video analytics on accuracy of chemobehavioural phenotyping in aquatic toxicology[J]. PeerJ, 2019, 7: e7367.
5) 劉慧杰, 王從鋒, 劉德富, 等. 不同運動狀態(tài)下鳙幼魚的游泳特性研究[J]. 南方水產(chǎn)科學(xué),2017, 13(2): 85-92.
6) Cruz-Rosa S, Pérez-Reyes O. Titanium Oxide Nanoparticles as Emerging Aquatic Pollutants: An Evaluation of the Nanotoxicity in the Freshwater Shrimp Larvae Atya lanipes[J]. Ecologies, 2023, 4(1): 141-151.
7) Rountos K J, Gobler C J, Pikitch E K. Ontogenetic differences in swimming behavior of fish exposed to the harmful dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides[J]. Transactions of the American Fisheries Society, 2017, 146(5): 1081-1091.
8) Nay T J, Johansen J L, Habary A, et al. Behavioural thermoregulation in a temperature-sensitive coral reef fish, the five-lined cardinalfish (Cheilodipterus quinquelineatus)[J]. Coral Reefs, 2015, 34: 1261-1265.


斑馬魚行為學(xué)視頻分析軟件

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021-35183767
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產(chǎn)品詳情

LoliTrack5是一款超級快速直觀的Windows軟件,用于2D和3D視頻跟蹤和動物行為分析。簡單地,從你的相機加載一個視頻文件到軟件,并開始跟蹤。跟蹤是基于對比或背景減法(不需要標(biāo)記),并且具有豐富的工具模塊可用于深入分析動物行為。



獨特的是,LoliTrack5可以在處理遮擋(即交叉軌跡)時識別和跟蹤自由放散的群體,如魚群、蟲群或群體中未標(biāo)記動物等。




LoliTrack5 的應(yīng)用:

·微孔板分析(如對斑馬魚分析)

·行為表型(病灶動物)

·嚙齒動物試驗(例如在迷宮或露天野外試驗)

·群體行為(如昆蟲、浮魚和微生物)

·移動行為(例如在籠子,水族館和野外)

·社會和性行為(如IID和動物取向)


使用方式:


LoliTrack5適用于大多數(shù)相機和視頻文件格式。只需用相機錄制一個視頻文件,并將視頻加載到軟件中開始跟蹤。該軟件也具有視頻錄制和編輯工具,使用方便,一站式解決。


使用標(biāo)配或自備的視頻采集設(shè)備采集到動物的運動圖像,導(dǎo)入到LoliTrack5中進(jìn)行識別和分析,即可輸出分析數(shù)據(jù),可分析參數(shù)包括如:位置、速度、加速度、方向、旋轉(zhuǎn)等。


產(chǎn)品特點:

1.同時追蹤1-24只動物(一個單位容器)

2.支持多個單位容器同時追蹤,如24、48、96孔板等

3.兼容大多是相機和視頻格式

4.具有豐富的分析工具集,可分析20+個數(shù)據(jù)參數(shù)

5.確定具體的身體點進(jìn)行運動和運動學(xué)研究

6.生成并導(dǎo)出數(shù)據(jù)參數(shù)和分布熱圖

7.具有可定制圖形的深度分析工具

8.可用頻率分析估計心率和鰓頻率

9.真正的三維跟蹤導(dǎo)出坐標(biāo)和三維路徑

10.批量分析多個視頻,節(jié)省時間



分析參數(shù):

1.加速度

2.移動距離

3.速度和速度

4.激*/非激*時間和%

5.到區(qū)域中心的距離

6.在區(qū)域中花費的時間和百分比

7.運動方向和方向

8.轉(zhuǎn)動速度:移動或方向的轉(zhuǎn)動速度

9.動物到區(qū)域中心的距離

10.個體間距離(IID)

11.平均個體間距離(AIID)

12.個體間距離中位數(shù)(MIID)

13.*近鄰距離(NND)

14.彎曲(即身體擺動的角度,如尾拍頻率等)

15.前、后、中線中心和重心的原始和校準(zhǔn)的X/Y位置



軟件功能示例:

可以選擇單個的動物進(jìn)行跟蹤和分析,而不是必須跟蹤所有的動物。自定義名稱和標(biāo)簽顏色,便于識別。還可以在視頻時間軸上選擇用戶自定義的時間間隔,以排除特定的視頻片段進(jìn)行跟蹤。





如果您想要分析特定感興趣區(qū)域內(nèi)的動物行為,可以直接在視頻預(yù)覽中繪制任意數(shù)量的區(qū)域。對每個區(qū)域的行為進(jìn)行評分,并自動導(dǎo)出每個區(qū)域的統(tǒng)計數(shù)據(jù)。


識別特定的身體點(尾巴、頭部、中線中心、重心),并可以單獨跟蹤每個點,用于研究運動學(xué)(尾部拍頻、身體振蕩等)或特定行為(方向或運動方向、轉(zhuǎn)彎速率等)。其他有用的工具包括根據(jù)位置、速度、加速度、活動和轉(zhuǎn)彎速率生成動物的中線和熱圖。

您可以將所有數(shù)據(jù)參數(shù)導(dǎo)出為.xlsx文件到Excel,只需單擊一次。導(dǎo)出每個參數(shù)或選擇你需要的參數(shù)。在導(dǎo)出的文件中,您

可以獲得單個動物、動物組以及每個用戶定義的測試單元和區(qū)域的分析數(shù)據(jù)和原始數(shù)據(jù)。在LoliTrack5中,一些參數(shù)也可以作為可定制或作為圖形導(dǎo)出。



通過兩個攝像頭或文件(立體技術(shù)),LoliTrack5提供了在空氣或水中的焦點動物的真實3D視頻跟蹤,考慮到空氣到水的光傳輸因素。坐標(biāo)以及軌跡的數(shù)字3D模型可以以不同的格式導(dǎo)出,以便在其他軟件包中進(jìn)一步可視化或分析。






相關(guān)文獻(xiàn):

1) Alcaraz A J G, Baraniuk S, Mikulá?ek K, et al. Comparative analysis of transcriptomic points-of-departure (tPODs) and apical responses in embryo-larval fathead minnows exposed to fluoxetine[J]. Environmental Pollution, 2022, 295: 118667.
2) Di Cicco M, Di Lorenzo T, Fiasca B, et al. Effects of diclofenac on the swimming behavior and antioxidant enzyme activities of the freshwater interstitial crustacean Bryocamptus pygmaeus (Crustacea, Harpacticoida)[J]. Science of the Total Environment, 2021, 799:149461.
3) Wang X, Cheng E, Burnett I S, et al. Automatic multiple zebrafish larvae tracking in unconstrained microscopic video conditions[J]. Scientific reports, 2017, 7(1): 17596.
4) Henry J, Rodriguez A, Wlodkowic D. Impact of digital video analytics on accuracy of chemobehavioural phenotyping in aquatic toxicology[J]. PeerJ, 2019, 7: e7367.
5) 劉慧杰, 王從鋒, 劉德富, 等. 不同運動狀態(tài)下鳙幼魚的游泳特性研究[J]. 南方水產(chǎn)科學(xué),2017, 13(2): 85-92.
6) Cruz-Rosa S, Pérez-Reyes O. Titanium Oxide Nanoparticles as Emerging Aquatic Pollutants: An Evaluation of the Nanotoxicity in the Freshwater Shrimp Larvae Atya lanipes[J]. Ecologies, 2023, 4(1): 141-151.
7) Rountos K J, Gobler C J, Pikitch E K. Ontogenetic differences in swimming behavior of fish exposed to the harmful dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides[J]. Transactions of the American Fisheries Society, 2017, 146(5): 1081-1091.
8) Nay T J, Johansen J L, Habary A, et al. Behavioural thermoregulation in a temperature-sensitive coral reef fish, the five-lined cardinalfish (Cheilodipterus quinquelineatus)[J]. Coral Reefs, 2015, 34: 1261-1265.


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